《中國銀行則例》公布后，財政部于1913年5月23日咨請外交部轉知各國銀行，中國銀行“實系國家之中央銀行”。中國銀行于1912年至1928年間成為了南京臨時政府和北洋政府的中央銀行。

當時國家雖然名為獨立，但是財政金融大權實為帝國主義外商銀行所掌握，加之政府腐敗，軍閥混戰，中國銀行處境艱難。但中行仍積極發揮中央銀行職能，努力加快發展，抗衡外商銀行。

一、代理國庫。作為中央銀行，中國銀行受政府委托經理國庫。

（一）收兌軍用票券。由于當時戰事頻繁，所需經費浩大，造成財政困難，軍用票券于是被大量發行。南京臨時政府發行各種軍用鈔票共500萬元，中國銀行設立多處軍用鈔票兌現處進行軍票收兌工作，效果顯著。1913年3月4日，中國銀行復函財政部稱已陸續收回軍鈔499.1萬元，至此收兌軍用票券工作告一段落。

（二）代收稅款。1913年4月，財政部頒布金庫章程，委托中行掌握總金庫和全國分支金庫，希望逐步把金庫統一起來。中行積極籌備接收各省金庫，或設分行，或托官銀錢號代理。在接收過程中遇到了不少困難，很多地方金庫以要求中行在地方有困難時提供墊款為條件，拖延移交。后經多方努力，至1915年底，中行已接收各地關稅21處、鹽稅38處、各省金庫15處，經收稅款占全國稅收50％以上。中行在接受金庫的過程中雖然墊付了六七百萬元而未能收回，但也因此廣設分支機構，擴大了存放款和匯款業務。

（三）經理外債本息的償付。北洋政府除承認清政府所借大量外債外，又繼續大舉外債，在短短的16年間，共借外債387次，金額約計12.8億元。作為中央銀行，中行承擔了經付外債本息的任務。時常因為政府撥款不足，中行須代政府墊款，給中行帶來不少損失。

二、協助政府辦理公債事務。中行受政府委托，辦理募集或償還公債事務。北洋政府從1912年到1926年正式發行債券27種，金額達6.1億元。中行是以上債券的主要經募人和銷售人，同時也通過銷售中的折扣和手續費等獲取利益。

中國政府1913年向海外發行公債，由中國銀行代理

三、發行貨幣。1914年2月8日，《國幣條例》公布，中國銀行是該條例的主要執行者，發揮中央銀行作用。各地中行會同交行回收舊銀幣改鑄“袁大頭”銀元，后來改以生銀鑄造，新幣產量日益增加，逐漸成為流通主幣。“袁頭幣”鑄造量很大，估計在5.9億元以上。本次發行的新幣可以稱得上是中國鑄幣史上唯一獲得成功的銀幣。

由于歷史上中國紙幣不如外國紙幣幣信好，加之當時國庫尚未統一，金庫支付不可能都用中行鈔券，這些客觀因素給中行發行紙幣帶來了極大的困難。從1912年起到1915年底，中行發行紙幣額折合銀元從106萬元增為3844萬元，雖然增長了38倍，但是距當時市場的需要數量相差還很遠。1915年政府公布《取締紙幣條例》，規定銀錢行號一律禁止發行紙幣，已發行的紙幣，須在規定期限內收回。原來有發行權的銀行，其所需兌換券得向中行領用。為此上海中行創設了領用暗記券制度。所謂暗記券是指發券銀行在鈔券上加一暗記，代表不同的地名和領券單位，有關專業人員據此可識別這些鈔券是由哪一家銀行所領用或回籠。這一制度是中國銀行紙幣發行史上的獨特創造。實現領用暗記券制度后，發券行和領用行都逐漸增加，效果顯著。

中國銀行在北洋政府期間，兌換券發行額直線上升，1912年發行額為106萬，1927發行額增為1.59億元，增長了150多倍。這對建立穩定的金融秩序發揮了很大作用。同時，中行作為中央銀行期間，財政墊款問題嚴重，到1925年底，中行墊款積欠數為2373萬元，占各銀行墊款總積欠數的78％以上，中行的財政墊款數額之大和負擔之重，由此可見一斑，這對中行的發展產生了嚴重影響。

在行使中央銀行職能的16年間，中行走過了一段不尋常的前進歷程，在曲折中實現發展。到1928年底，全國各發行銀行的發行總額約2.95億元（不包括不兌現紙幣），中行發行額占58%；全國各銀行的存款總額為9.83億元，中行的存款額占39%，成為當時國內規模最大、實力最強、信譽最好的銀行，為后來中國銀行的近代化和國際化打下了堅實基礎。

中國銀行1913年-1927年資產總額增長圖（單位：元）